Глянул на форуме Mi, чел задавал вопрос по поводу пропажи второго пространства. Правда телефон у него Redmi 4 Prime. Ему посоветовали следующее - "В общем нужно зайти в режим разработчика ,там найти второе пространство с низу, и удалить его при помощи входа в аккаунт xiaomi. После этого перезагрузить устройство,и второе пространство будет на том же месте где и было до этого."... Судя по тому, что этот человек потом ответил - "Спасибо вам большое", видимо, ему этот совет помог.
P.S. посмотрел в ветке прошивок Redmi 6A на 4pda, за последние дни сообщений о пропаже второго пространства после обновы нет. Думаю, если это было бы массово из-за обновления, то там была бы уже куча сообщений по этому поводу.